La mer représente un enjeu majeur de l'aménagement du littoral et dans la gestion des zones côtières.Le contrat de Baie à Toulon, participe au rassemblement des énergies ainsi qu'à l'inventaire des forces et des faiblesses de la rade, qui, avec la co-existence d'usagers aussi multiples que la Marine nationale, la pêche, le commerce (dont l'autoroute de la mer) et la plaisance, représente un véritable enjeu de développement durable. Le dépôt de carburant du commissariat de la Marine du Lazaret a obtenir en février 2007 la certification environnement ISO 14001.